למידע נוסף על זן המין Paenibacillus VT 400
בקיץ 2016, בכנס השנתי של האגודה האמריקנית למיקרוביולוגיה, מדענים התאספו כדי לשתף ולדון בממצאים הקשורים לעולם החיידקים ובריאות האדם.
בין התגליות, קבוצה דיווחה על הגנום כולו, או על מערכת שלמה של גנים, עבור חיידק שנקרא זן Paenibacillus זן VT 400 (PVT400). חיידקים אלה נמצאו בעבר ברוק של חולה ילדים עם לוקמיה לימפובלסטית חריפה (ALL).
המידע המפורט ממחקר זה ומחקריו העתידיים יעזור למדענים ללמוד האם לחיידקים אלה יש תפקיד במחלות אנושיות, במיוחד באנשים עם לוקמיה חריפה המפתחים דלקת ריאות או דלקות בדם.
דלקת ריאות אצל אנשים עם סרטן
דלקת ריאות היא הגורם המוביל למוות בקרב חולי סרטן עם נויטרופניה, ובמיוחד אלו עם לוקמיה חריפה. נויטרופניה היא ספירה נמוכה של נויטרופילים בדם-נויטרופילים הם תאי דם לבנים החשובים בסיוע לגוף להילחם בזיהום .
זיהומים בדרכי הנשימה התחתונות נפוצים מאוד בקרב חולי סרטן, עם כמה דיווחים מראים כי 13 עד 31 אחוזים מהחולים לוקמיה לקבל כימותרפיה עד 80 אחוזים של המטופלים hematopoietic השתלות תאי גזע יחוו לפחות פרק אחד של דלקת ריאות.
דלקת ריאות נויטרופנית הן זיהומים שעלולים לסכן חיים. בתרחישים כאלה, רופאים מתחילים בטיפול אנטיביוטי באופן מיידי, מבלי לחכות לתוצאות מעבדה שיאשרו ויציינו את סוג החיידק - מכיוון שחשוב מאוד להתחיל את הטיפול בבת אחת, כדי להפחית את הסיכון שהחולה ייכנע לזיהום.
למעשה, טיפול מונע משמש בנסיבות מסוימות, המפורטות להלן.
ההתקדמות לאחרונה בניהול של דלקת ריאות neutropenic הם דוחפים תקווה לתוצאות טובות יותר. חברות רפואיות מרובות פרסמו הנחיות מעודכנות לטיפול אנטיביוטי בחשד לדלקת ריאות נויטרופנית.
וזה אפשרי כי סוכנים חדשים יותר לקדם את תגובות הגוף לזיהום עשוי להגביר עוד יותר את הפעילות של אנטיביוטיקה.
התמקדות פתוגנים בחולים עם נויטרופניה
הנחיות של האגודה האמריקאית לאונקולוגיה קלינית (ASCO) ממליצות לרופאים לנסות ולמנוע הידבקות בחולי חוץ עם נויטרופניה עמוקה אך ללא חום. טיפול אנטיבקטריאלי ו אנטי פטרייתי מומלץ אם נויטרופילים צפויים להישאר מתחת 100 / μL במשך יותר משבעה ימים. ההנחיה קובעת כי הסוכן המועדף לטיפול מניעתי אנטיבקטריאלי הוא פלואורוקוינולון אוראלי, בעוד שהטיפול האנטי-פטרייתי הוא טריאזול בעל פה.
חולים עם נויטרופניה הם רגישים למגוון רחב יותר של פתוגנים מאשר עמיתיהם. זה יכול להיות מועיל עבור הרופאים כדי לשקול מאיפה חיידקים הגיעו מ ניבוי אשר אנטיביוטיקה הם צפויים להיות עמיד, ולכן אילו אסטרטגיות הן הסיכוי הטוב ביותר להיות יעיל ביותר.
מינים פאיניבצ'ילוס
לשם כך, מדענים חוקרים את ה- PVT400, החיידק החדש המבודד מחולה הלוקמיה, חבר בסוג פניבצ'ילוס - משפחה של מינים חיידקים דמויי מוט. מינים שונים בתוך קבוצה זו היו מבודדים מקרקע, מים, צמחים, חלב, ואתרים אחרים.
עם זאת, מינים Paenibacillus לא היו ידועים לגרום למחלות אנושיות. .. עד הדיווחים האחרונים הראו מעורבות אפשרית של שלושה מיני Paenibacillus שונים במחלות אנושיות.
לאחר ש- PVT 400 היה מנותק מרוק של חולה ילדים עם לוקמיה לימפובלסטית חריפה , מחקרים מוקדמים הראו דמיון כלשהו בין המבודדים לבין מינים של אמילוליטיקוס, שנמצאו באדום הזחל של הזבוב; עם זאת, נכון לעכשיו, עדיין נכון כי P. amylolyticus לא זוהה בבני אדם, ומחקרים נוספים הראו הבדלים בין חיידק VT 400 המתח נמצא החולה סרטן אחרים P.
זנים של אמילוליטיקוס.
לכן, כאשר חוקרים בחנו את כל גנום ה- VT 400, היו מספר ממצאים מעניינים. זה היה גנים קידוד מנגנוני התנגדות תרופות כימותרפיה , כמו tunicamycin ו bleomycin. הם מצאו גם גנים למשאבות חיידקים הקשורים להתנגדות מרובת גידולים, כמו גם גנים המקודדים עמידות לאנטיביוטיקה, כולל vancomycin, fosmidomycin, tetracycline וכן תרופות כמו פניצילין, או בטא לקטמים.
מחברי המחקר הגנומי הזה ציינו כי רצף הגנום המלא של Paenibacillus sp. זן VT 400 יסייע לקבוע את התפקיד של מינים Paenibacillus במחלות האדם ולספק תובנות הרכב של חיידקים רגילים החיים בחולים עם סרטן הדם.
מקורות:
> אוואנס SE, אוסט DE. דלקת ריאות בחולה סרטן נויטרופני. Curr דעות Pulm Med . 2015, 21 (3): 260-271.
Rybakova D, Wetzlinger U, Müller H, et al. השלם רצף הגנום של Paenibacillus polymyxa זן SB3-1, חיידק groundborne עם פעילות אנטגוניסטית כלפי פתוגנים צמחים. הכרזה על הגנום . 2015; 3 (2): e00052-15.
דה סוזה R, Sant'Anna FH, Ambrosini A, et al. הגנום של פסודומונס. FeS53a, צמח מקדם חיידקים מקדם צמיחה הקשורים אורז גדל בקרקעות הדגיש ברזל. הכרזה על הגנום. 2015; (2): e00248-15. 10.1128 / genomeA.00248-15.
Spence R, Demchick P, Hornitzky M, et al. מעקבים של זיקוקים ניו זילנד עבור Paenibacillus alvei. NZ אנטומול . 2013, 36: 82-86.
קים KK, Lee KC, יו H, et al. Paenibacillus sputi sp. נוב, מבודדת מכיית חולה עם מחלת ריאות. אינטל J סיסט אוול Microbiol . 2010, 60: 2371-2376.
Mulcahy N. קו מנחה חדש ASCO על נויטרופניה חום. חדשות רפואיות. 16 ינואר, 2013 זמין ב http://www.medscape.com/viewarticle/777736.
פרחים CR, Seidenfeld J, Bow EJ, et al. טיפול מניעתי מיקרוביאלי וניהול אשפוז של חום ונויטרופניה אצל מבוגרים שטופלו על ממאירות: האגודה האמריקנית לאונקולוגיה קלינית של קו מנחה קליני . אונקול . 2013; 31 (6): 794-810.